98年國防報告書20日將對外正式公布，針對中共軍事威脅，報告書中指出，，現階段中共表面雖恢復兩岸協商，然共軍高層曾表示，「在雙方敵對關係未解除，還不會降低對台軍力」，共軍內部仍灌輸「台海必有一戰」的思維。

國防部認為，故在軍事立場上研判，短期兩岸敵對狀況，將不會隨兩岸關係和緩而解除。

報告書也認為，中共企圖軟化國軍意志，藉由簽訂和平協議包裹其政治目的，使我方難有抵抗能力，進而達到不戰而屈人之兵的企圖。

報告書在第八章「開創和平」中也強調推動軍事互信機制，並指「建立兩岸軍事互信機制」議題已在區域內發酵；儘管現階段兩岸關係和緩已使台海和平出現曙光，未來雙方亦可能進行更廣泛的交流與合作，惟台海長期以來的軍事對峙，仍是最複雜難解的議題。

國防部認為，然而，台海間的「軍事互信」因中共目前仍未調整對台軍事部署，亦改變其《反分裂國家法》得採取「非和平方式」處理兩岸問題的條文，固未能進一步推展。

報告書說，儘管目前兩岸關係初見緩和，但中共仍未承諾「放棄以武力犯台」，國軍仍須堅定自我防衛決心與強化建軍備戰能力，以嚇阻戰爭發生。